1 lipca 2007 roku powołano „Zarząd Portu Morskiego Mrzeżyno”, będący jednostką budżetową gminy Trzebiatów. Celem ZPM było, między innymi przeprowadzenie remontów infrastruktury portowej, przygotowanie portu do bezpiecznej żeglugi turystycznej.
W latach 2013–2015 dokonano modernizacji modernizowano nabrzeża portowe o łącznej długości 429 m, które wyposażono w punkty poboru wody i energii elektrycznej. Wybudowane zostały: basen remontowy wraz z budynkiem warsztatowym i slipem do obsługi jednostek rybackich stacjonujących w porcie, budynek bezpośredniej sprzedaży ryb z magazynem, chłodnią i wytwornicą lodu. Przebudowano drogi, place, kanalizację sanitarną, kanalizację deszczową, sieci energetyczne i sieci wodociągowe. Wybudowane zostały punkty zdawania wód zaolejonych i ścieków komunalnych z jednostek rybackich, a także obiekt administracyjny portu. Koszt inwestycji miał wynosić 40 mln zł, przy dofinansowaniu z Unii Europejskiej w wysokości 31 mln zł.